Nein, getrennt eingestellt aber auf den selben Wert.
Hab das Auto inzwischen wieder aus der Werkstatt zurück, die unterschiedliche Temperatur war einer der Gründe.
Maßgabe von Skoda ist nun wohl.....Armaturenbrett zerlegen/ausbauen, Sensoren und Klappen prüfen.
Als wir 28 Grad Außentemperatur hatten war auch die Kühlleistung mehr als unzureichend.
Beiden Seiten auf "low" links kamen 23 Grad raus , rechts 17 Grad.......beides zu hohe Werte aber eben auch Unterschiedlich.
Wer weiß ob da event. die Heizung und Kühlung gegeneinander kämpfen...... 
Interessant war auch.......Kompressordrehzahl bei 10400 U/Min und "nur" 2,8 KW Leistungsaufnahme.
Hatte im Winter, dort natürlich Heizen statt kühlen, 8200 U/Min und 4,5 KW Leistungsaufnahme.
Klingt ja eigentlich nach zu wenig CO2 und der Kompressor versucht das durch mehr Drehzahl zu kompensieren um auf Druck zu kommen, schafft das aber nicht weil zu wenig Gas zum komprimieren vorhanden ist....somit auch weniger Last und damit weniger Leistungsaufnahme.
Das sind natürlich nur meine persönlichen Gedanken die aber technisch zusammen passen würden.
Apropos "mind. 2-Zonen-Klima"
Guter Gedanke, ich werde mal hinten messen, habe eine 3 Zonen Klimatisierung